在刑事訴訟上，分成三大階段，第一階段是偵查，第二階段是審判，第三階段是執行，審判程序由法院主導，法官是主體，偵查與執行階段主體是檢察官，由檢察官主導程序的進行。
　　行刑權是司法機關於有罪判決在確定後，對行為人予以執行的權力，此權力有期限限制，除了約制檢察官在期限內行使之外，還是對行為人的一種優惠設計。在法律上，舉凡政府得以行使權力的情形，都會加註一個期間的限制，「別讓你的權利睡著了」這句話用在公權力之一方有類同效果，只是從「權利」變成了「權力」。
　　根據刑法關於行刑權的相關條文，見諸刑法第８４條、第８５條兩條文，將行刑權之時效期間與行刑權時效之停止明文化，行刑權之時效期間依刑法第８４條：「行刑權因下列期間內未執行而消滅：一　宣告死刑、無期徒刑或十年以上有期徒刑者，四十年。二　宣告三年以上十年未滿有期徒刑者，三十年。三　宣告一年以上三年未滿有期徒刑者，十五年。四　宣告一年未滿有期徒刑、拘役、罰金或專科沒收者，七年。（第二項）前項期間，自裁判確定之日起算。但因保安處分先於刑罰執行者，自保安處分執行完畢之日起算。」行刑權是國家對於已終局確定之科刑判決，執行其宣告刑之權力，行刑權的時效期間，依判決確定日起算，而９４年增修但書因保安處分先於刑罰執行者，自保安處分完畢之日起算，其增修理由在於實務上常有於保安處分執行完畢後，致他罪刑罰之行刑權時效罹於消滅之情形，實有違宣告刑罰之本質。
　　關於行刑權時效之停止，因９４年的修法有大幅的不同，舊刑法第８５條第１項：「行刑權之時效，如依法律之規定不能開始或繼續執行時，停止其進行。」現行刑法在同條項之規定：「行刑權之時效，因刑之執行而停止進行。有下列情形之一而不能開始或繼續執行時，亦同：一　依法應停止執行者。二　因受刑人逃匿而通緝或執行期間脫逃未能繼續執行者。三　受刑人依法另受拘束自由者。」關於妨礙行刑權時效完成之事由，仍維持現行時效停止制，僅就不能開始或繼續執行之情刑，詳加列舉，以資適用。其中因受刑人逃亡或藏匿而通緝，不能開始或繼續執行者，依釋字第１２３號，認為行刑權時效應停止進行；另受刑人執行中脫逃，雖處於未執行狀況，但行刑權時效仍不宜繼續進行，因此予以明文化，以資適用。