侵害專利權之刑責存廢問題，行政院終於核定自九十二年三月三十一日施行，對於目前侵害專利之刑事糾紛案件，終於獲得解套了，爾後侵害專利之案件，將完全回歸由民事訴訟程序去解決，檢察官也不再受理專利侵權案。 　　專利侵害是否予以刑事制裁，按與貿易有關之智慧財產權協定（TRIPS）第61條規定得由各國自行決定。在九十年十月以前，我國專利法規定凡侵害專利權者，包括發明專利、新型專利及新式樣專利，均有刑事責任，惟多年實務運作下來，卻造成權利人利用刑罰規定，藉檢察官之偵查權，打擊競爭對手，對其財產施以搜索、扣押，造成競爭對手營業上及名譽上無法彌補之傷害。因此，產業界屢有廢除專利刑事責任的建議，於九十年經濟發展諮詢委員會議中，智財權除罪化，更是業界的共識意見。繼而於九十年十月的專利法修正案中，立法院刪除了侵害技術層次較高之發明專利的刑事責任，但仍保留侵害技術層次較低之新型專利及新式樣專利的刑事責任，以致產生輕重失衡不合理現象，再加上新型專利將改採形式審查，為能兼顧立法價值的一致性，立法院再於九十二年一月三日三讀通過新修正之專利法，將侵害新型專利及新式樣專利的刑事責任均予廢除，並於九十二年二月六日經總統明令修正公布。因本次專利法為全盤修正，多項修正涉及專利制度之重大變革，俟相關配套措施完成後，經濟部才會報請行政院核定施行日期。惟自新法公布以來，各界相當關心新法的施行日期，尤其檢察署檢察官及法院法官對於新法何時施行？涉及認事用法及司法審理的問題，如新法施行後，裁判中之案件可為免訴判決，偵查中之案件可為不起訴處分，涉及人民之訴訟權益及司法審判實務作業極大，新法究何時施行已造成司法審理實務上之困擾。因此，行政院基於司法的安定性及刑罰刪除條文先施行，並不影響專利制度的運作，而核定中華民國九十二年二月六日修正公布「專利法」刪除現行之第八十三條、第一百二十五條、第一百二十六條、第一百二十八條至第一百三十一條，自九十二年三月三十一日施行。